توالی‌یابی ChIP
شرح خدمت
توالی‌یابی- ChIP (ChIP-Seq) به‌طور گسترده در تجزیه و تحلیل برهمکنش پروتئین با DNA استفاده می‌شود. ما تجربه گسترده‌ای در زمینه ارائه خدمات مرتبط با نیازهای تحقیقاتی با استفاده از ChiP-Seq داریم. توالی‌یابی-ChIP به طور گسترده‌ای برای تجزیه و تحلیل تعامل پروتئین با DNA استفاده می‌شود. برای شناسایی جایگاه های اتصال پروتئین‌های مرتبط با DNA در این روش، رسوب گذاری ایمنی کروماتین (chromatin immunoprecipitation (ChIP)) با توالی‌یابی DNA موازی انبوه ترکیب شده و می‌تواند برای نقشه یابی دقیق جایگاه های اتصال عمومی برای هر پروتئین مورد نظر استفاده گردد. توالی‌یابی-ChIP در مقایسه با رویکردهای ChIP-chip مبتنی بر آرایه، وضوح بالاتر و اطلاعات دقیق‌تر و فراوان‌تری ارائه می‌دهد.
علاوه بر ارائه داده‌های تمیز در قالب فایل های استاندارد، شرکت BGI دامنه‌ای از پایپ لاین های پردازش بیوانفورماتیک استاندارد، پیشرفته و سفارشی برای پروژه تجزیه و تحلیل ChiP-Seq به شما ارائه می‌دهد. ما تخصص ویژه‌ای در زمینه تجزیه و تحلیل همبستگی بیان افتراقی ژن‌ها مبتنی بر RNA-Seq و ژن‌های مرتبط با پیک ChIP-Seq داریم. برای آگاهی در این خصوص، با کارشناسان ما تماس بگیرید.
مشخصات خدمات توالی‌یابی
خدمات ChiP-Seq با فناوری توالی‌یابی DNBSEQ شرکت BGI انجام می‌شود، که برای ارتقاء کیفیت داده، از ترکیب probe-anchor synthesis (cPAS) و فناوری DNA Nanoballs (DNB) بهره می برد.
مشخصات خدمات
- خوانش های توالی‌یابی یک طرفه 50bp Single-end.
- خروجی استاندارد 20 میلیون خوانش در هر نمونه.
- داده‌های تمیز و تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک در فرمت‌های استاندارد موجود است.
- قابلیت ذخیره سازی داده‌ها و کاربردهای بیوانفورماتیک.
- سیستم ذخیره سازی و تحویل داده مبتنی بر فضای ابری.
الزامات نمونه
ChIP-ed DNA: مقدار ≥ 10ng، غلظت ≥ 1 ng/µl.
ChIP 15 µl -ed DNA (فقط نمونه انسانی): مقدار ≥ 5ng، غلظت ≥ 1 ng/µl.
مدت زمان ارائه خدمات
- 25 روز کاری معمولی از زمان پذیرش کنترل کیفیت (QC) نمونه تا تحویل نهایی داده‌ها.
- امکان تسریع در ارائه خدمات وجود دارد.
