پروفایل لیپیدومیکس (Lipidomic Profiling)
شرح خدمت
خدمات پروفایل لیپیدومیکس BGI، برای ایجاد پروفایل لیپیدی و غربالگری بیان افتراقی لیپیدها در نمونه، طراحی شده است. BGI دارای تجارب گسترده‌ای در زمینه پروفایل لیپیدومیکس با گردش کار اختصاصی قابل اعتماد با استفاده از فناوری‌های پیشرو این صنعت و زیرساخت بیوانفورماتیک پیشرفته است.
خدمات پروفایل لیپیدومیکس BGI با تلفیق نرم افزار LipidSearch و تجزیه و تحلیل الگوریتم پیشرفته، امکان تأیید ویژگی های ساختار لیپیدها از جمله ساختار سر مولکول لیپید، طول زنجیره شاخه اسید چرب و تعداد پیوند دوگانه غیر اشباع را از طریق مقایسه ویژگی سیگنالی یون‌های پیش‌ساز، قطعات MS2 و neutral loss، امکان پذیر می‌کند. LipidSearch، مجهز به بزرگترین پایگاه داده لیپیدها است که 8 گروه و 300 زیرگروه لیپیدی را پوشش می‌دهد و حاوی بیش از 1.7 میلیون یون لیپید و اطلاعات مرتبط با پیش‌بینی آنها است.
گردش کار پروژه
مشخصات سرویس طیف سنجی جرمی
خدمات پروفایل لیپیدومیکس، با استفاده از Waters ACQUITY UPLC و طیف‌سنج جرمی پیشرفته (Q Exactive HF/HF-X) انجام می‌شود.
آماده سازی نمونه و خدمات
- با استفاده از ستون ACQUITY UPLC CSH C18، عمق پوشش متابولوم را افزایش دهید.
- تشخیص ESI (+) و (-) توسط طیف سنج جرمی Q Exactive HF/HF-X.
استاندارد کیفیت
- خلاصه، شامل کلیه روش‌ها و تجزیه و تحلیل داده‌ها است.
- گزارش‌ها در قالب Excel یا PDF ارائه می‌شوند. در صورت درخواست، فایل‌های داده های خام نیز قابل ارائه است.
مدت زمان ارائه خدمات
- معمولاً 5-7 هفته پس از دریافت نمونه تا تحویل داده های خام.
الزامات نمونه
ما نمونه‌های متابولیت را در فرمت‌های مختلف می‌پذیریم. برای آگاهی از جزئیات مرتبط با نمونه‌های خود، با نماینده BGI تماس بگیرید.
|
نوع نمونه |
مقدار نمونه توصیه شده |
حداقل مقدار نمونه |
|
سرم، پلاسما |
≥ 300 µL |
≥ 100 µL |
|
ادرار |
≥ 300 µL |
≥ 100 µL |
|
بافت‌های حیوانی و بالینی |
≥ 200 mg |
≥ 25 mg |
|
مدفوع و محتویات روده |
≥ 200 mg |
≥ 25 mg |
|
سلول |
1×10^7 |
5×10^6 |
|
میکروارگانیسم |
≥ 200 mg |
≥ 25 mg |
|
محیط کشت، محیط تخمیر |
≥ 1 mL |
≥ 100 µL |
|
شیر |
≥ 1 mL |
≥ 100 µL |
|
سایر مایعات بدن (مایع آمنیوتیک، بزاق، همولنف، مایع مغزی نخاعی و غیره) |
≥ 300 µL |
≥ 100 µL |
تحلیل داده‌ها
- تجزیه و تحلیل داده‌ها با کتابخانه metaX1 و BGI انجام می‌شود.
- T-test، PCA، PLS-DA، OPLS-DA برای شناسایی متابولیک افتراقی.
- آنالیز خوشه‌ای.
- تفسیر مسیر متابولیت.
- تجزیه و تحلیل ROC.
- تجزیه و تحلیل همبستگی متابولیت.
