تعیین ژنوتیپ با استفاده از تکنیک MassARRAY

شرح خدمت

پلتفرم ™Sequenom MassARRAY iPLEX مبتنی بر فناوری طیف‌سنج جرمی یونیزاسیون دفعی لیزر به کمک ماتریکس (MALDI-TOF MS) (طیف سنجی جرمی) است که در BGI برای تعیین ژنوتیپ استفاده می‌شود. این فناوری دارای مزایای بسیاری مانند انعطاف در طراحی آزمایشی و نتایج دقیق تعیین ژنوتیپ بوده و در صورت آزمایش صدها یا هزاران نمونه برای ده‌ها مکان SNP مقرون‌به‌صرفه است. ما با استفاده از پلت فرم MassARRAY، قادر به تشخیص HPV، HBV و ژن‌های مرتبط با سرطان بر اساس تعیین ژنوتیپ هستیم تا نیازهای تجزیه و تحلیل SNP با بازدهی بالا در دوران پسا ژنومیک را برآورده کنیم.

مزایا

• حساسیت بالا: قابلیت تشخیص تفاوت در کیفیت 1 مولکول دالتون در پشتیبانی فناوری DNA pooling، با دقت بیش از 99.7 درصد.
• عملیات تمام مکانیزه، تجزیه و تحلیل اتوماتیک داده‌ها ، تایید دقیق، کنترل کیفیت و حذف خطای انسانی.
• سیستم چند واکنشی: تجزیه و تحلیل همزمان هر واکنش به (افزایش حفره) تا 36 SNP.
• تجزیه و تحلیل اتوماتیک داده‌ها: تشخیص به صورت زمان واقعی (real-time)، خوانش مستقیم جایگاه SNP، طبقه بندی خودکار.

کاربردها

• تعیین ژنوتیپ بر اساس SNP.
• درمان دارویی فردی برای سرطان – KRAS EGFR و غیره.
• خدمات آزمون ژنوتیپ برای ویروس پاپیلومای انسانی (HPV).
• تشخیص ژن مقاوم به دارو ویروس هپاتیت B (HBV).

الزامات نمونه

• مقدار DNA : ≥1μg DNA برای 1 تا 100 جایگاه SNP.

≥ 2μg DNA برای بیش از 100 جایگاه SNP.

• غلظت: ≥ 50 ng /μL.
• خلوص: OD260/280=1.8~2.0.

شاخص تکمیلی

در نمونه‌هایی که آزمون DNA - OD را گذرانده‌اند، میزان موفقیت فراخوانی SNP کمتر از 50 درصد نیست؛ برای نمونه‌هایی که کنترل کیفیت داخلی را پشت سر می‌گذارند، میزان موفقیت فراخوانی SNP کمتر از 90 درصد نخواهد بود.

مدت زمان ارائه خدمات

برای 100 نمونه (هر نمونه با 25 جایگاه SNP)، زمان انجام پروژه حدود 30 روز کاری است. زمان واقعی انجام پروژه به میزان نمونه و جایگاه‌های SNP بستگی دارد.