توالی یابی متاژنوم (Metagenomic Sequencing)
شرح خدمت
مطالعات متاژنومیکس بر روی مواد ژنتیکی که مستقیماً از نمونه‌های محیطی بازیابی می‌شوند، از فناوری پیشرفته NGS به‌عنوان روشی برای اکتشاف تنوع زیستی میکروبی بهره‌مند شده‌اند. در ارائه خدمات مرتبط با بررسی متاژنومیک در شرکت ما، از توالی‌یابی شات گان کل ژنوم DNA جدا شده از نمونه‌های محیطی پیچیده یا انسانی شامل دستگاه گوارش، خاک و آب، با مزایای بازدهی و پوشش بالا، استفاده می شود. این خدمت نه تنها می‌تواند اطلاعاتی را در مورد ترکیب و فراوانی گونه‌ها فراهم سازد، بلکه اطلاعاتی در مورد ژن‌های عملکردی، تفاوت‌های ژنی بین نمونه‌ها، مسیرهای متابولیک و کاوش منابع ژنی برای شناسایی محصولات زیست فعال مانند آنزیم های جدید و سایر بیوکاتالیست ها ارائه دهد.
مقیاس توالی‌یابی و فناوری اختصاصی ما، امکان ارائه قیمت‌هایی بسیار رقابتی را تضمین می‌کند؛ همچنین، تجربه فراوان ما در دامنه گسترده‌ای از پروژه‌های متاژنومیکس، این اطمینان را به شما می‌دهد که کارشناسان این مجموعه قادر به ارائه راه‌حل‌های بیوانفورماتیک سفارشی هستند که می‌تواند به توضیح رابطه بین جوامع میکروبی مرتبط با میزبان و فنوتیپ میزبان کمک کند.
جزئیات خدمات کلیدی
- خدمات توالی‌یابی بررسی متاژنومیک DNBSEQ با سیستم توالی یابی DNBSEQ اجرا می‌شود.
- گزارش‌ها و فایل‌های داده خروجی در قالب‌های فرمت‌های استاندارد متداول ارائه می‌شوند: داده‌های BAM، xls.، png. و FASTQ.
- توالی‌یابی دو طرفه (Paired-End) bp
استاندارد کیفی توالی‌یابی
- PE100 یا PE150.
- تضمین 85 درصد بازها با امتیاز کیفی Q20.
- داده توالی‌یابی به نوع نمونه بستگی دارد.
الزامات نمونه
نمونه‌های معمولی:
DNA ژنومی دست نخورده ≥ μg 1.5.
غلظت ≥ ng/μl 20.
حجم 15 μl.
نمونه‌هایی با مقادیر کم:
DNA ژنومی دست نخورده ≥ 200 ng.
غلظت ≥ 2.5 ng/μl.
حجم 15 μl.
مدت زمان ارائه خدمات
- معمولاً 40 روز کاری از پذیرش کنترل کیفیت (QC) نمونه تا ارائه داده های خام پیرایش شده.
- امکان تسریع در ارائه خدمات وجود دارد.
