متاپروتئومیکس (Metaproteomics)

گردش کار پروژه

در صورتی که نمونه‌های ساخت کتابخانه مناسب وجود نداشته باشد، تجزیه و تحلیل DDA را می‌توان انجام داد:

• استخراج پروتئین
• هضم پروتئین
• نمونه‌های اختصاصی
• LC-MS/MS (DDA)

در صورت وجود نمونه‌های مناسب برای ساخت کتابخانه، می‌توان تحلیل DIA انجام داد.

مشخصات سرویس طیف سنجی جرمی

خدمات متاپروتئومیکس با استفاده از کروماتوگرافی مایع با جریان نانو (Nano-flow liquid chromatography) و طیف‌سنج جرمی پیشرفته (Q Exactive HF/HF-X و Orbitrap Fusion Lumos) انجام می‌شود.

آماده سازی نمونه و خدمات

• آنالیز QC هیدرولیز آنزیمی به طور دقیق توسط LC-MS کنترل می‌شود.
• کتابخانه طیفی DDA با استفاده از فناوری HPLC و Fractionation نمونه ایجاد می‌شود.

استاندارد کیفیت

• خلاصه، شامل کلیه روش‌ها و تجزیه و تحلیل داده‌ها است.
• گزارش‌ها در قالب Excel یا PDF ارائه می‌شود. در صورت درخواست، امکان ارائه فایل‌های خام نیز وجود دارد

مدت زمان ارائه خدمات

• معمولاً 5-4 هفته از زمان پذیرش QC نمونه تا تحویل گزارش داده‌ها.

تحلیل داده‌ها

• تجزیه و تحلیل داده‌ها و اعتبار سنجی با Mascot انجام می‌شود.
• آنالیز پروتئین
• تجزیه و تحلیل گونه‌ها
• تجزیه و تحلیل تنوع
• تجزیه و تحلیل عملکرد
• تجزیه و تحلیل همبستگی.