پپتیدومیکس / Peptide mapping
شرح خدمات
BGI خدماتی LC-MS/MS peptide mapping را در زمینه پشتیبانی از کاربردهای این فناوری در حوزه های زیست دارو و زیست فناوری ارائه می‌دهد. خدمات نقشه یابی پپتیدها برای توصیف و بررسی جزئیات مولکول داروی پروتئینی درمانی، در هر موقعیتی در توالی اسیدآمینه، طراحی شده است. درهمین زمینه، خدمات نقشه یابی دیسولفید و نقشه یابی اپیتوپ نیز ارائه می‌شود.
گردش کار پروژه
تأیید توالی
ما خدمات تأیید توالی اسیدهای‌آمینه و نقشه یابی PTM را برای پروتئین‌های خالص شده، ارائه می‌دهیم. خدمات ما برای اعتبارسنجی دقیق بیان پروتئین‌های نوترکیب یا شناسایی PTMهای مرتبط با فرآیند در داروهای بیولوژیک مفید است.
- آماده سازی دقیق نمونه
- نمونه‌های اختصاصی
- تجزیه و تحلیل داده‌های نقشه پپتیدی.
ارزیابی مولکولی
ما می‌توانیم در تشخیص عملکرد احتمالی توالی اسیدآمینه به شما کمک کنیم. در این شرکت، خدمات ارزیابی مولکولی برای بررسی تغییرات اسید آمینه خاص در پاسخ به تیمار تخریب اجباری منطبق با اهداف پروژه شما ارائه می شود. خدمات ما برای پوشش توالی پپتیدی با دامنه دینامیکی بالا بهینه سازی شده است.
- سری های تخریب اجباری نمونه
- آماده سازی دقیق نمونه
- تجزیه و تحلیل LC-UV-MS/MS DDA
- تجزیه و تحلیل داده‌های نقشه پپتیدی
- پروفایل ارزیابی مولکولی.
مشخصات سرویس طیف سنجی جرمی
خدمات نقشه یابی پپتیدی با استفاده از analytical flow liquid chromatography، تشخیص UV و high resolution Orbitrap mass spectrometry انجام می‌شود.
آماده سازی نمونه و خدمات
- هضم ملایم با استفاده از تریپسین با کیفیت بالا برای توالی‌یابی یا پروتئولیز جایگزین طراحی شده برای به حداقل رساندن اثرات جانبی آماده سازی نمونه انجام می‌شود.
- تشخیص UV به صورت In-line نیز امکان‌پذیر است. برای حداقل اکسیداسیون نمونه بهینه شده است.
- هر قطعه با استفاده از 150 دقیقه analytical flow LC-MS/MS با استفاده از طیف سنج جرمی Q Exactive HF-X Orbitrap آنالیز می‌شود.
- تجزیه و تحلیل و اعتبارسنجی داده‌ها با نرم افزار BioPharma Finder انجام می‌شود.
- می‌توانیم با استفاده از نرم‌افزار Chromeleon 7 (مطابق با (21 CFR Part 11 برای توسعه سرویس‌های سفارشی Multi-Attribute Method (MAM) با شما همکاری کنیم.
استاندارد کیفیت
- خلاصه، شامل کلیه روش‌ها و تجزیه و تحلیل داده‌ها است.
- گزارش‌ها در قالب Excel یا PDF ارائه می‌شود. در صورت درخواست، امکان ارائه فایل‌های خام نیز وجود دارد.
مدت زمان ارائه خدمات
- معمولاً 20 روز کاری از زمان پذیرش QC نمونه تا تحویل گزارش داده‌ها.
الزامات نمونه
|
نوع نمونه |
مقدار و غلظت |
حداقل حجم نمونه |
|
نمونه بیولوژیکی خالص شده در محلول مایع |
توصیه شده: 1000 µg; 10 µg/µL |
100 µL |
|
نمونه بیولوژیکی خالص شده در محلول مایع |
حداقل مورد نیاز: 10 µg; 1 µg/µL |
10 µL |
تحلیل داده‌ها
بیوانفورماتیک پیشرفته
- تجزیه و تحلیل و اعتبارسنجی داده‌ها با نرم افزار BioPharma Finder انجام می‌شود.
- روش نقشه یابی پپتیدی برای شناسایی انواع توالی، تغییرات ناشناخته، و اشغال همزمان PTM
- وضعیت PTM محل اسیدآمینه و فراوانی نسبی
- گزارش‌ها در قالب Excel یا PDF ارائه می‌شود. در صورت درخواست، امکان ارائه فایل‌های خام نیز وجود دارد.
