شناسایی پروتئین (Protein Identification)

شرح خدمات

کروماتوگرافی مایع مدرن و فناوری طیف سنجی جرمی، ابزاری را برای انجام فرآیند متداول شناسایی پروتئین غیرهدفمند فراهم می‌کند. BGI می‌تواند به تسهیل چالش شناسایی پروتئین پروژه شما کمک کند.

گردش کار پروژه

شناسایی در ژل

ما می توانیم پروتئین‌های جدا شده از نوارها یا نقاط ژل را شناسایی کنیم. خدمات ما شامل رنگ‌زدایی، هضم در ژل، LC- nano-flow LC-MS/MS، و تجزیه و تحلیل داده‌های منطبق با طیف پپتیدی است.

شناسایی در محلول

خدمات شناسایی پروتئین در محلول ما را می‌توان در مواردی مانند پایش بیان پروتئین نوترکیب و سیستم‌های تخلیص میل ترکیبی استفاده کرد.

مشخصات سرویس طیف سنجی جرمی

خدمات شناسایی پروتئین با استفاده از Nano-flow liquid chromatography و طیف سنجی جرمی Orbitrap با وضوح بالا انجام می‌شود.

آماده سازی نمونه و خدمات

• هضم با استفاده از تریپسین با کیفیت مناسب برای توالی‌یابی انجام می‌شود.
• 60 دقیقه Nano-flow LC-MS/MS با استفاده از طیف سنج جرمی Q Exactive HF-X Orbitrap

استاندارد کیفیت خدمات Mass Spec

• خلاصه، شامل کلیه روش‌ها و تجزیه و تحلیل داده‌ها است.
• گزارش‌ها در قالب Excel یا PDF ارائه می‌شود. در صورت درخواست، امکان ارائه فایل‌های خام نیز وجود دارد.

مدت زمان ارائه خدمات

• معمولاً 2-3 هفته از زمان پذیرش QC نمونه تا تحویل گزارش داده‌ها.
• امکان ارائه خدمات ویژه سریع در یک هفته وجود دارد.

الزامات نمونه

نمونه‌های پروتئین را به صورت محلول یا ژل می‌پذیریم. برای نمونه‌های پیچیده در محلول، می‌توانیم خدمات الکتروفورز، از جمله preparative SDS-PAGE و رنگ آمیزی تحلیلی را نیز ارائه دهیم.

تحلیل داده‌ها

بیوانفورماتیک پیشرفته

• تجزیه و تحلیل داده‌ها و اعتبار سنجی با SEQUEST یا Mascot انجام می شود.
• شناسایی عالی پروتئین، شمارش منطبق با طیف پپتیدی، و پوشش توالی نیز ارائه شده است.
• تا 30 پروتئین با شمارش منطبق با طیف پپتیدی رتبه بندی می شوند.