متابولومیک غیر هدفمند (Untargeted Metabolomics)
شرح خدمت
BGI دارای تجارب گسترده‌ای در زمینه متابولومیک غیرهدفمند با گردش کار اختصاصی قابل اعتماد با استفاده از فناوری‌های پیشرو این صنعت و زیرساخت بیوانفورماتیک پیشرفته است.
شرکت BGI با بکارگیری سیستم‌ها و تکنیک‌های پیشرفته LC-MS/MS، گردش‌های کاری معتبر مرتبط با متابولومیک غیرهدفمند را برای پشتیبانی از برنامه‌های زیست پزشکی و زیست فناوری ارائه می‌کند. خدمات متابولومیک غیرهدفمند ما برای ایجاد پروفایل متابولیت و غربالگری بیان افتراقی مولکول‌ها در نمونه، طراحی شده‌اند.
گردش کار پروژه
مشخصات سرویس طیف سنجی جرمی
خدمات متابولومیک غیرهدفمند با استفاده از Waters ACQUITY UPLC و طیف سنج جرمی پیشرفته (Q Exactive HF/HF-X و Q-TOF 5600) انجام می‌شود.
آماده سازی نمونه و خدمات
- با استفاده از ACQUITY UPLC BEH C18 و ستون Amide، عمق پوشش متابولوم را افزایش دهید.
- تشخیص ESI (+) و (-) توسط طیف سنج جرمی Q Exactive HF/HF-X.
استاندارد کیفیت
- خلاصه، شامل کلیه روش‌ها و تجزیه و تحلیل داده‌ها است.
- گزارش‌ها در قالب Excel یا PDF ارائه می‌شوند. در صورت درخواست، فایل‌های داده های خام نیز قابل ارائه است.
مدت زمان ارائه خدمات
- معمولاً 5-7 هفته پس از دریافت نمونه تا تحویل داده های خام.
الزامات نمونه
ما نمونه‌های متابولیت را در فرمت‌های مختلف می‌پذیریم. برای آگاهی از جزئیات مرتبط با نمونه‌های خود، با نماینده BGI تماس بگیرید.
|
نوع نمونه |
مقدار نمونه توصیه شده |
حداقل مقدار نمونه |
|
سرم، پلاسما |
≥ 300 µL |
≥ 100 µL |
|
ادرار |
≥ 300 µL |
≥ 100 µL |
|
بافت‌های حیوانی و بالینی |
≥ 200 mg |
≥ 25 mg |
|
مدفوع و محتویات روده |
≥ 200 mg |
≥ 25 mg |
|
سلول |
1×10^7 |
5×10^6 |
|
میکروارگانیسم |
≥ 200 mg |
≥ 25 mg |
|
محیط کشت، محیط تخمیر |
≥ 1 mL |
≥ 100 µL |
|
شیر |
≥ 1 mL |
≥ 100 µL |
|
سایر مایعات بدن (مایع آمنیوتیک، بزاق، همولنف، مایع مغزی نخاعی و غیره) |
≥ 300 µL |
≥ 100 µL |
تحلیل داده‌ها
- تجزیه و تحلیل داده‌ها با کتابخانه metaX1 و BGI انجام می‌شود.
- T-test، PCA، PLS-DA، OPLS-DA برای شناسایی متابولیت‌های افتراقی.
- آنالیز خوشه‌ای.
- تفسیر مسیر متابولیت.
- تجزیه و تحلیل ROC.
- تجزیه و تحلیل همبستگی متابولیت.
