توالی یابی کل متیلوم (Whole Genome Bisulfite Sequencing)

شرح خدمت

توالی‌یابی  بی سولفیت کل ژنوم (WGBS) راه حلی مقیاس‌پذیر، برای تعیین خصوصیات سلولی و پروفایل بیان ژنی صدها تا میلیون‌ها سلول ارائه می‌دهد. متیلاسیون DNA در جایگاه پنجم سیتوزین (5-mC) یک تغییر اپی‌ژنتیکی پایدار است که نقشی مهم در  بسیاری از فرآیندهای زیستی از جمله خاموش کردن ژن، سرکوب عناصر جابجا شونده، نقش پذیری (نشانه گذاری) ژنومی و غیرفعال سازی کروموزوم X ایفا می‌کند. تشخیص و تعیین کمیت متیلاسیون برای درک بیان ژن و سایر فرآیندهای تحت تنظیم اپی‌ژنتیک بسیار مهم است.

در توالی‌یابی بی سولفیت کل ژنوم (WGBS)، برای شناسایی سیتوزین‌های متیله شده، از تیمار DNA با بی‌سولفیت سدیم قبل از توالی‌یابی استفاده می شود. WGBS به یک روش استاندارد طلایی در مطالعه متیلاسیون در سطح ژنوم با وضوح در سطح یک باز تبدیل شده است.

مشخصات سرویس توالی‌یابی

توالی‌یابی بی سولفیت کل ژنوم (WGBS) ما، با استفاده از فناوری DNBSEQ انجام می‌شود.

جزئیات خدمات کلیدی

• علاوه بر داده‌های تمیز، ما دامنه وسیعی از گزینه‌های استاندارد و سفارشی بیوانفورماتیک را برای کل پروژه توالی‌یابی بی‌سولفیت ژنوم شما ارائه می دهیم.
• گزارش‌ها و داده‌های خروجی در فرمت‌های استاندارد متداول ارائه می‌شوند: FASTQ، BAM، cout، .xls، png.

آماده سازی نمونه و خدمات

• آماده سازی کتابخانه، از جمله تیمار بی‌سولفیت.
• توالی‌یابی دو طرفه (paired-end) 100bp .
• داده‌های تمیز، تجزیه و تحلیل داده‌های استاندارد و سفارشی.
• امکان ذخیره سازی داده‌های موجود و برنامه‌های کاربردی بیوانفورماتیک.

استاندارد کیفیت توالی

• تضمین بالای 85 درصد از بازهای تمیز با امتیاز کیفیت Q20.
• تضمین نرخ تبدیل بی‌سولفیت ≥99%.
• پوشش توالی‌یابی استاندارد ≥30X توصیه می‌شود.

الزامات نمونه

نمونه‌های معمولی: DNA ژنومی دست نخورده ≥ 1μg، غلظت ≥ 50ng/μl

نمونه‌هایی با مقادیر کم: DNA ژنومی دست نخورده ≥ 100ng، غلظت ≥ 7ng/μl

مدت زمان ارائه خدمات

• معمولاً 40 روز کاری از زمان پذیرش کنترل کیفیت (QC) نمونه تا تحویل داده‌های خام پیرایش شده.
• امکان تسریع در ارائه خدمات وجود دارد.