خدمات کمی پروتئومیک (Quantitative Proteomics)

 خدمات کمی پروتئومیک

BGI از چندین فرآیند برای کمی‌سازی پروتئومیک پشتیبانی می‌کند. ما راه‌حل‌های نوآورانه‌ای برای بهینه‌سازی فرآیند کمی سازی دقیق پروتئین‌ها در ماتریس‌های زیستی پیچیده و سایر مخلوط‌های پیچیده توسعه داده‌ایم. خدمات کمی ما عبارتند از: Label-Free Data-Independent Acquisition (DIA)، Isobaric Label (iTRAQ, TMT and IBT tag)، Rapid DDA Proteomics، پروتئومیکس هدفمند (MRM/PRM)، Nanoproteomics، پروتئومیکس FFPE و متاپروتئومیکس.

ما از همکاری با شما برای تعیین بهترین خدمات پروتئومیکس کمی، در پروژه شما استقبال می کنیم.

 کمی سازی Label-free DIA

روش تجزیه و تحلیل داده (DIA)، یک تکنیک کمی بدون برچسب است که کمی سازی بسیار پایدار و پوشش پروتئوم گسترده‌ای ارائه می‌دهد. در این روش، یک کتابخانه طیفی سفارشی با نمونه خاص شما ایجاد کرده و سپس، نمونه‌های اختصاصی را با استفاده از nano-flow LC-MS/MS در DIA scanning mode تجزیه و تحلیل می‌کنیم.

خدمات کمی سازی پروتئومیکس DIA بدون برچسب، برای پروژه‌های بلندمدت یا پروژه‌هایی با مجموعه‌های بزرگ نمونه که نیاز به کمی سازی دقیق و قابل تکرار دارند، ایده‌آل است.

برچسب ایزوباریک

خدمات ایزوباریک نشاندار شامل مالتی‌پلکس سازی نمونه برای ارائه پوشش عمیق پروتئوم و کمی سازی بسیار دقیق مجموعه نمونه‌های کوچک یا متوسط است.

BGI خدمات پروتئومیکس کمی ایزوباریک نشاندار را با استفاده از فناوری‌های iTRAQ (برچسب‌های ایزوباریک برای کمی‌سازی نسبی و مطلق) ، IBT (برچسب‌های ایزوباریک برای کمی‌سازی) و TMT (Tandem Mass Tags برای کمی سازی) توسعه‌یافته توسط AB SCIEX، BGI و Thermo Scientific ارائه می دهد.

پروتئومیکس Rapid DDA

برخلاف پروتئومیکس‌های کمی‌سازی وابسته به برچسب (مانند روش iTRAQ)، پروتئومیکس بدون برچسب (DDA) نیازی به استفاده از ایزوتوپ گران قیمت پایدار برای نشاندار کردن پروتئین‌ها ندارد. این روش، امکان تعیین کمیت دقیق پروتئین نمونه‌ها را بدون واکنش‌های برچسب‌گذاری در شرایط آزمایشگاهی (منجر به بروز خطا در فرآیند) فراهم کرده و شناسایی و کمی سازی سریع پروتئوم را ممکن می‌سازد.

پروتئومیکس هدفمند

تجزیه و تحلیل پروتئین هدف به روش متداول مبتنی بر تکنیک‌های آنتی‌بادی بوده که دارای محدودیت‌هایی در بازدهی و میزان اختصاصیت است. بااین‌حال، رویکردهای نظارت بر واکنش چندگانه (MRM) و نظارت بر واکنش موازی (PRM) قادر به حل این محدودیت‌ها هستند.

فناوری MRM/PRM مبتنی بر پلتفرم‌های MS، به‌عنوان استاندارد طلایی در تحقیقات هدفمند پروتئومیکس، می‌تواند به سرعت و با دقت ده‌ها پروتئین را به طور همزمان در نمونه‌های زیستی پیچیده تعیین کرده و مشکلات مرتبط با کندی فرآیند راستی‌آزمایی را مرتفع سازد.

نانوپروتئومیکس

Nanoproteomics به تجزیه و تحلیل کمی پروتئومیکس جمعیت‌های کوچک سلولی (معمولاً < 5,000 سلول) با ترکیبی از برش in-situ و فناوری بدون برچسب DDA اشاره دارد و شرایطی را برای تجزیه و تحلیل پروتئین ها ارائه می‌دهد که با روش استخراج پروتئین و طیف سنجی جرمی متداول، امکانپذیر نیست.

BGI دارای تجارب گسترده‌ای در زمینه نانوپروتئومیک است که تحقیقات هتروژنی سلولی در جمعیت‌های سلولی نادر، نمونه‌های بالینی (که به دست آوردن آنها سخت است) و بافت‌های پاتولوژیک را شامل می شود.

پروتئومیکسFFPE

نمونه FFPE، به نمونه بافت تیمار شده با روش FFPE اطلاق می‌شود که می تواند به‌طور پیوسته برای چندین دهه در دمای اتاق ذخیره شود و استاندارد طلایی برای تجزیه و تحلیل هیستوپاتولوژیک است.

BGI تجربه گسترده‌ای در زمینه پروتئومیکس FFPE در تحقیقات هتروژنی تومور دارد.

متاپروتئومیکس

از زمان معرفی این روش در سال 2004، هدف متاپروتئومیکس شناسایی همه پروتئین‌های بیان شده توسط میکروبیوم محیطی در مقیاس وسیع و در مقطع زمانی‌ مشخص بوده است، که می‌تواند منجر به مطالعه عمیق تنوع، ساختار و عملکرد بالقوه ژن ها در جوامع میکروبی گردد.

BGI تجربه گسترده‌ای در زمینه تحقیقات میکروارگانیسم‌های متاپروتئومیک در نمونه‌های مدفوع انسانی، نمونه‌های آب و نمونه‌های نوشیدنی های تخمیری، دارد.